L'école est structurée en cinq départements qui regroupent chacun les formations Bachelor et Master d'un même champ disciplinaire. Placé sous la conduite d’un responsable, membre du Conseil de direction de la HEAD – Genève, chaque département dispose d’un secrétariat chargé d’accompagner les étudiant·e·x·s dans leurs parcours d’études.
Un Bachelor et trois orientations du Master HES-SO en arts visuels. Avec plus de deux-cent-cinquante étudiant·e·x·s et une cinquantaine d'enseignant·e·x·s – artistes, théoricien·ne·x·s et curateur·rice·x·s – le Département arts visuels est le plus grand de Suisse.
Un Bachelor et un Master conduit conjointement avec l’École cantonale d’art de Lausanne (ECAL). Les étudiant·e·x·s du Département cinéma se forment aux multiples métiers du cinéma à travers la création de films.
Deux formations Bachelor – communication visuelle et illustration – et deux orientations du Master HES-SO en design – Media Design et Visual Knowledge. Les étudiant·e·x·s du Département communication visuelle développent des pratiques allant du graphisme à la narration en images, des cultures numériques à la didactique visuelle,
Un Bachelor, un Master et une orientation du Master HES-SO en design – Design Installation. Les étudiant·e·x·s du Département design d’espace explorent les multiples dimensions des espaces intérieurs – de la transformation des bâtiments à la scénographie.
Deux formations Bachelor – design mode et design bijou et accessoires – et une orientation du Master HES-SO en design – design mode et accessoires. Les étudiant·e·x·s du Département design mode, bijou et accessoires se forment au design de produits autour du corps humain et de ses extensions. Le département accueille également la Chaire de design horloger, un modèle unique à l’échelle internationale.